财务管理是医院运营管理的核心，医院所有的经济活动都需要通过财务管理系统及时、准确的反映出来，财务管理系统的规划完全遵循《政府会计制度》、《医院会计制度》、《医院财务管理》要求，在满足新《政府会计制度》“双基础、双功能、双报告”的平行记账模式下，实现财务、预算日常的凭证记账、审核、结账、现金管理、应收、应付、报销管理、固定资产、存货核算、院内票据管理等业务管理的前提下，与医院业务系统（物资、药品、收费、报销、预算等）实现整合并自动生成凭证，实时反映医院真实的经营活动，提供财务管理需要的各种报表和统计数据。
 
搭建双体系核算账簿，一套财务核算账簿的模式之下，搭建财务会计科目+预算会计科目的会计科目体系，凭证制单节点显示财务会计和预算会计两个凭证界面，对平行记账的经济业务根据财务会计凭证自动生成预算会计凭证；系统生成会计科目勾稽差异项目，自动记录汇总差异；业务系统自动生成的财务凭证根据凭证中会计科目性质自动判断和生成预算会计凭证。根据财务会计科目形成财务会计账，出具财务会计报表，根据预算会计科目形成预算会计账和决算报告。